1339 a legrégebbi évszám, mikor először bukkan fel „Kis Folud”, a mai Zselickisfalud ősének a neve. Ekkor Baranya vármegyéhez tartozott. A török idők után fennmaradt legrégibb összeírás 1691-ben készült a kaposvári várhoz tartozó Esterházy birtokról. A falu 1909-ben kapta a Zselickisfalud nevet. A faluban egy római katolikus és egy református elemi népiskola működött egy-egy tanítóval, egy-egy tanteremben.
A falu főterén (2000. év óta Hősök tere) álló régi épületben kapott helyet a faluház terme, a Polgármesteri Hivatal kis irodája és az orvosi szoba.

A falu templomát 1952-ben építették közösségi összefogással. 1995-97 között készült el a templom külső és belső festése, majd a harangok villamosítása. 2001-2002-ben kialakították a liturgikus teret. A templom búcsúja Nagyboldogasszony (aug. 15.).